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Text File  |  1995-03-04  |  3.0 KB  |  55 lines
  1. ************************************************************
  2. * Serine/threonine specific protein phosphatases signature *
  3. ************************************************************
  4.  
  5. Serine/threonine specific protein phosphatases  (EC 3.1.3.16) (PP) [1,2,3] are
  6. enzymes that catalyze the removal of a phosphate group attached to a serine or
  7. a threonine  residue.  They  are  very  important in controlling intracellular
  8. events in  eukaryotic  cells.  In mammalian tissues four different types of PP
  9. have been  identified  and  are  known as PP1, PP2A, PP2B and PP2C. Except for
  10. PP2C, these enzymes are evolutionary related.
  11.  
  12.  - Protein  phosphatase-1  (PP1)  is  an  enzyme  of broad specificity.  It is
  13.    inhibited by  two  thermostable  proteins,  inhibitor-1 and -2. In mammals,
  14.    there are  two  closely  related  isoforms of PP-1: PP-1alpha and PP-1beta,
  15.    produced by  alternative splicing of the same gene. In Emericella nidulans,
  16.    PP-1 (gene  bimG)  plays  an important role in mitosis control by reversing
  17.    the action  of  the  nimA kinase. In yeast, PP-1 (gene SIT4) is involved in
  18.    dephosphorylating the large subunit of RNA polymerase II.
  19.  - Protein phosphatase-2A (PP2A) is also an enzyme of broad specificity.  PP2A
  20.    is a trimeric enzyme that consist of a core composed of a catalytic subunit
  21.    associated with a 65 Kd regulatory subunit and a third variable subunit. In
  22.    mammals, there are two closely  related isoforms  of  the catalytic subunit
  23.    of PP2A: PP2A-alpha and PP2A-beta, encoded by separate genes.
  24.  - Protein phosphatase-2B  (PP2B or calcineurin), a  calcium-dependent  enzyme
  25.    whose activity is stimulated by calmodulin. It is composed of two subunits:
  26.    the catalytic A-subunit and the calcium-binding B-subunit.  The specificity
  27.    of PP2B is restricted.
  28.  
  29. In addition to the above-mentioned  enzymes, some  additional serine/threonine
  30. specific protein phosphatases have been characterized and are listed below.
  31.  
  32.  - Mammalian phosphatase-X (PP-X), and  Drosophila  phosphatase-V (PP-V) which
  33.    are closely related but yet distinct from PP2A.
  34.  - Yeast  phosphatase  PPH3,  which  is  similar  to  PP2A, but with different
  35.    enzymatic properties.
  36.  - Drosophila  phosphatase-Y  (PP-Y),  and yeast phosphatases Z1 and Z2 (genes
  37.    PPZ1 and PPZ2) which are closely related but yet distinct from PP1.
  38.  - Bacteriophages Lambda and Phi-80 ORF-221  which  have  been  shown  to have
  39.    phosphatase activity and are related to mammalian PP's.
  40.  
  41. The best  conserved  regions  in  these  proteins  is  a  perfectly  conserved
  42. pentapeptide that can be used as a signature pattern.
  43.  
  44. -Consensus pattern: [LIVM]-R-G-N-H-E
  45. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  46. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: chicken neurofilament M protein.
  47. -Last update: June 1994 / Text revised.
  48.  
  49. [ 1] Cohen P.
  50.      Annu. Rev. Biochem. 58:453-508(1989).
  51. [ 2] Cohen P., Cohen P.T.W.
  52.      J. Biol. Chem. 264:21435-21438(1989).
  53. [ 3] Cohen P.T.W., Brewis N.D., Hughes V., Mann D.J.
  54.      FEBS Lett. 268:355-359(1990).
  55.